A justificação de uma guerra com a integridade de um império multicontinental e a recusa de negociações com os independentistas comportavam, para os militares portugueses, condições muito adversas.

A guerra processava-se em três territórios, de muito elevada dimensão, se comparados com Portugal continental, e com condições geográficas e climatéricas muito distintas.
Os teatros de operações eram descontínuos e distantes entre si e ainda mais distantes da sede do poder político e militar português, gerando problemas logísticos e agravando os custos financeiros. Nos cenários de guerra, movimentava-se mais do que um adversário, cujos métodos agravavam as formas e os processos de planificação.

A prossecução dos conflitos por uma década tornou o recrutamento um problema transversal a toda a sociedade portuguesa, afetando a relação com o regime político e a sua base de apoio.

Para as correntes em oposição ao Salazarismo, a Guerra Colonial abriu uma nova e mais significativa frente de contestação. O Partido Comunista Português e os setores de matriz republicana, socialista e demoliberal introduziram o fim da guerra entre as suas reivindicações.

Entre os estudantes, sobretudo universitários, o recrutamento militar, a par da duração da permanência no teatro de guerra, tornou-se uma matéria cada vez mais sensível. A mobilização de novos setores em oposição declarada ao regime, a diversificação de métodos de contestação e a sua radicalização contribuíram para o alargamento da rutura com o regime ditatorial.

Revistas lançadas por católicos com significativo impacto público, como O Tempo e o Modo, e iniciativas como a Cooperativa Pragma permitiram alargar a base de contestação num setor usualmente tido como afeto ao regime. O mesmo se diga da produção e da difusão – mesmo que fortemente restringidas pelas instâncias de repressão do regime – de boletins com informações, dossiers sobre a Guerra Colonial portuguesa e reflexões sobre a doutrina pontifícia em torno de conflitos armados. São os casos de Direito à Informação, Cadernos GEDOC, Boletim Anti-Colonial ou Cadernos sobre a Guerra Colonial.

Figuras com posições de destaque no catolicismo e em rota de colisão com o regime e com a hierarquia legitimaram e intensificaram outras formas de dissidência política. O impacto público do caso do Padre Felicidade Alves constitui um dos momentos mais significativos desses processos.