Na noite de 27 para 28 de setembro arrancara a operação do COPCON, esquematizada duas semanas antes, de prisão de elementos da extinta LP, mas que, em virtude dos recentes acontecimentos, passara a incluir também a detenção dos envolvidos na organização da manifestação.
São detidas várias figuras por estarem alegadamente envolvidas em conspirações e nas movimentações da «maioria silenciosa», como Kaúlza de Arriaga, Silva Cunha, Moreira Baptista, Franco Nogueira, Elmano Alves, Conde Caria, Casal Ribeiro, Manuel Múrias, Barbieri Cardoso, Florentino Goulart Nogueira ou o locutor Artur Agostinho.
Alguns dos visados denunciam prisões ilegais, feitas por civis ou com mandados de captura em branco, e detenções de pessoas que não estariam envolvidas diretamente na manifestação.
Também a 2.ª Divisão do Estado-Maior General das Forças Armadas (Informações) realiza várias detenções.